W dniu 10 marca 2005 r. została zatwierdzona nowa, zaktualizowana wersja "Wytycznych dla Instytucji Pośredniczących w zarządzaniu dotyczących podstawowych wymogów do programowania i przygotowywania projektów do Funduszu Spójności w okresie programowania 2004-2006". Szczególnie istotne z punktu widzenia zrównoważonego rozwoju jest położenie nacisku na konieczność zakończenia postępowania ws. oceny oddziaływania na środowisko oraz uwzględnienia sieci Natura 2000 poprzez umieszczenie odpowiednich zapisów oraz dodanie w formie Załącznika nr 5 Wytycznych odnośnie postępowania w zakresie oceny oddziaływania na środowisko (OOŚ) dla przedsięwzięć współfinansowanych z Funduszu Spójności. Należy nadmienić, że tylko jedna ocena oddziaływania na środowisko spośród ocen dołączonych do projektów zatwierdzonych przez Komisję Europejską w 2004 r. w ramach części środowiskowej Funduszu Spójności nie wzbudziła zastrzeżeń Komisji. W opinii urzędników Komisji w prawie polskim są pewne niezgodności z dyrektywami Unii Europejskiej związane właśnie z oceną oddziaływania na środowisko i rozbieżności te należy jednoznacznie wyjaśnić i dostosować obowiązujące prawo do wymogów unijnych. Do czasu wejścia w życie projektowanych zmian ustawy Prawo ochrony środowiska eliminacji ewentualnych błedów w procedurze OOŚ grożących odrzuceniem wniosku przez Komisję posłużą ww. Wytyczne odnośnie postępowania w zakresie OOŚ. Tekst Wytycznych u dołu strony.